На счет КЛАДРа не знаю, но у людей, живущих в Калинино, прописка начинается со слова «г. Краснодар», а в законе об образовании МО г. Краснодар ни Северного, ни Калинино не значится, равно как и Пашковского. Т.е. нынче это есть suburbы. Так что оставляем в черте города.
Витаминкомбинат, кстати, тоже ПГТ и считается районом Краснодара.