Ojo, no es lo mismo dibujar encima, que reutilizar la vía en una relación, he hecho un dibujo para que se entienda:
- El río entero es la línea A
- La frontera son tres lineas B-C-D, dentro de una relación
- Una de estas lineas fronterizas comparte los mismos nodos que el río, A está parcialmente debajo de C
Esta superposición de elementos no es incorrecta, ya que se sigue tratando de elementos diferentes.
Ahora bien, este caso por desgracia no es el más común, si no que se suele dividir la vía original (en el ejemplo, partir la vía A en tres trozos), y se mete en la relación administrativa un cacho de río. Esta manera de mapear me temo que es debida la facilidad que en JOSM, pulsando Ctrl+B se crean multipolígonos.
Este caso es problemático puesto que se trata que un mismo elemento (vía) contiene dos características: waterway y boundary.
Por la zona que comenta @Spaghetti_Monster, en torno a Murcia, me he encontrado con infinidad de límites administrativos que utilizan todo lo que haya por el camino: carreteras, acequias, calles, verjas… lo cual complica de sobremanera las ediciones.