Moin !
bei uns wurde eine Buslinie ersatzlos gestrichen - was nun aber mit der Relation?
Löschen - oder bestehenlassen falls diese doch noch einmal reaktiviert wird. Ist eines an Arbeit diese “einzusammeln”.
Gruß Jan 
Servus!
Damit nicht einer seine (mittlerweile veralteten) Daten wieder einträgt (weil er z.B. an Vandalismus denkt), würde ich die Relation sowieso noch eine Zeit bestehen lassen. Auf Dauer würde ich sie entfernen, da eine nicht geplfegte Relation mit der Zeit soweiso defekt wird und ein Neuaufbau einfach ist.
Man könnte auch den type=route der Relation entfernen, damit sie nicht mehr als Route erkannt wird, und einen note=* dranhängen, der erklärt, dass es die Route nicht mehr gibt.