Кто слепой? Я слепой. В самом верху конфига:

# put here the name of keys for ways that are assumed to be polygons if they are closed
# see http://wiki.openstreetmap.org/wiki/Map_Features
closed_ways_are_polygons=aeroway,amenity,boundary,building,craft,geological,historic,landuse,leisure,military,natural,office,place,shop,sport,tourism

Сбило меня еще то, что некоторые другие ривербанки всё-таки превращались в полигоны, но на них висели и другие теги, которые могли повлиять на решение. Но так совпало, что эти ривербанки были не просто замкнутым way-контуром, а отношением типа мультиполигон, т.к. по разным причинам либо склеивались из нескольких линий, либо имели inner-вырезку.

Такие дела. Полдня провозился. Спасибо.