А если попробовать открыть файл в Merkaator’е, сохранить его с новым именем, а потом попробовать открыть его в JOSM?
А какую версию JOSM используете?
Кстати, можете прочитать как бороться с конфликтами в JOSM — https://josm.openstreetmap.de/wiki/Uk%3AHelp/Dialog/Conflict