Это конечно жестоко, но где-то тут среди сотни страниц есть ссылка на poly файлы по которым происходит обрезка. Они заданы с большим размахом, что затягивают соседние области. Если ты его поправишь, исключив “левые” НП, но оставит замкнутые дороги выходящие немного в другие области, то ошибки пропадут.