Я по возможности стараюсь не удалять, а исправлять, чтоб хоть как-то сохранить историю правок.
Да, дороги прорисованные по н-надцать раз см. тему об Ивано-Франковске (http://forum.openstreetmap.org/viewtopic.php?id=13179) это тот еще головняк.
Дороги без пересечений - это вообще самое простое. UtilsPlugin2 Shift+I … и все пересечения готовы.