если внимательно читали о апи 0.6 то там есть новый парамметр version
если при заливке данных josm обнаруживает несоответствие версий(точнее это обнаруживает сервер и ставит josm перед фактом) - он выдаёт ошибку и предлагает провести мерджинг изменений. выбрать какой из вариантов (ваш или на сервере) точнее.
при чем это не просто предупреждение от которого можно отмахнуться кнопкой ОК
это именно диалог мерджинга. где надо сделать набор телодвижений и явно подтвердить своё решение