Cuando se armó la jerarquía no se la hizo pensando exclusivamente en el ruteo de la misma manera que no se tuvo en cuenta la visualización del mapa, el principio de no mapear para el render es fácilmente extensible a no mapear para el navegador GPS. De todos modos parte de la lógica fue tratar que las rutas de mayor jerarquía se distingan de las de menor entre otras cosas para el ruteo. Una de las motivaciones es que en muchas provincias hay rutas nacionales que son peores que las provinciales, con el esquema viejo un ruteador podría hacerte ir por la nacional un poco más larga solo por ser nacional.
Recién contesté el que pasaste que rutea mal, si tenés otros casos pasalo y lo analizamos.
Si hay algo en la jerarquía que se pueda mejorar es cuestión de plantearlo, de mi experiencia previa casi siempre los problemas son un nodo desconectado, un barrier que alguien metió pensando que era otra cosa, una velocidad máxima que falta, una jerarquía mal puesta, siempre son datos. La otra es que estemos ante excepciones que bien pueden ser tratadas como tal y cambiar una jerarquía en consecuencia.