Если какой-то конвертер умеет только одну схему маппинга, а в наличии есть эквивалентная, но другая - в большинстве случаев можно написать препроцессор, который сделает из имеющихся данных те, что хочет данная программа. Данные корёжить в базе совершенно не обязательно.