Ich habs mal damit probiert:

way["highway"="motorway"](47,6,54,14);
node
  (around:100)
  ["operator"="Subway"];
out body;

Bzw. damit:

way["highway"="motorway"](47,6,54,14);
node
  (around:100)
  ["name"="Subway"];
out body;

Das sollte alle Subways in der Nähe (Umkreis 100m) einer Autobahn im Raum Deutschland liefern. (Tatsächlich bekomme ich nur bei der ersten der beiden Anfragen einen Treffer…) Für andere Gegenden / Umkreisradien müsstest du die Zahlenwerte natürlich etwas anpassen.