osmosis^
 --read-xml file="Damp.osm"^
 --sort outPipe.0=mydamp^
 --read-xml file="File.osm"^
 --sort outPipe.0=myfile^
 --merge inPipe.0=mydamp inPipe.1=myfile^
 --write-xml file="Merged.osm"

В полученный файл попадут объекты с последними версиями.