Спасибо, в выгрузке от 20.05 это исправлено.
Есть новые вопросы.
На карте есть объект - точка “центр города”, и на nm2 она расположена правильно.
Но кроме того центр города можно найти и адресным поиском > поиск по адресу, город, нажимаем “результат”, не выбирая никакую улицу.
В
version="Навител Навигатор 3.2.6"
name="Свердловская область"
bbox=".poly файл OpenStreetMap"
date="20.05.2016 13:16"
convertedby="Kostik"
source="gis-lab.info"
description="Обрезка по границе области из OSM"
converterver="osm2mp - Revision 777; osm2navitel - Revision 188"
capital="55.7516147, 37.6187012"
и
version="Навител Навигатор 3.2.6"
name="Тюменская область"
bbox=".poly файл OpenStreetMap"
date="20.05.2016 16:34"
convertedby="Kostik"
source="gis-lab.info"
description="Обрезка по границе области из OSM"
converterver="osm2mp - Revision 777; osm2navitel - Revision 188"
capital="55.7516147, 37.6187012"
это сделано весьма странно - через адресный поиск в качестве цетра города находятся какие то узловые ж/д станции.
Екб - точка финиша это “центр города в адресном поиске”
Тюмень - точка старта это “центр города в адресном поиске”
И отдельный вопрос про объекты POI “километровые столбы”.
Они исчезли 
В
version="Навител Навигатор 3.2.6"
name="Тюменская область"
bbox=".poly файл OpenStreetMap"
date="29.12.2015 01:37"
convertedby="Fortress"
source="gis-lab.info"
description="Обрезка по границе области из OSM"
converterver="osm2mp - Revision 777; osm2navitel - Revision 191"
capital="55.7516147, 37.6187012"
Они были

А в
version="Навител Навигатор 3.2.6"
name="Тюменская область"
bbox=".poly файл OpenStreetMap"
date="21.04.2016 06:19"
convertedby="Fortress"
source="gis-lab.info"
description="Обрезка по границе области из OSM"
converterver="osm2mp - Revision 777; osm2navitel - Revision 191"
capital="55.7516147, 37.6187012"
, и последующих их уже нету
Печалька.