Vielleicht kannst du noch ein anderes Programm testen, um zu probieren, ob die Kommunikationsprobleme an BT747 liegen. Ich habe noch so dunkel im Hinterkopf, dass sich das Programm bei mir früher auch manchmal verschluckt hat und keinen Kontakt zum iblue 747 A+ herstellen konnte.
Hast du gpsbabel ausprobiert? Meine Tracks übertrage ich mit diesem gpsbabel-Befehl:
gpsbabel -t -w -i mtk -o gpx -f /dev/ttyACM0 -F iblue.gpx
Das ist bei mir ein Ubuntu-System, aber ebenfalls 64 Bit.