Verrate uns doch mal was du genau vorhast. Dann hilft es sich einfacher.
Zum Filtern gibt es zwei sicher einige Programme. Ein sehr schnelles spezialsiertes Tool wäre http://wiki.openstreetmap.org/wiki/DE:Osmfilter. Das ist wirklich flink, hat aber den Nachteil keine pbf mehr schreiben zu können.
Oder das OSM Universaltool http://wiki.openstreetmap.org/wiki/DE:Osmosis