Es ist eigentlich der reine Zufall, bis mal jemand an der kritischen Stelle eine Änderung macht und das so unwissend auspoliert.
Ich glaube aber gelesen zu haben, dass die Daten für Mapnik alle paar Monate mal total ersetzt werden, um genau die hier diskussierten Probleme zu korrigieren.
Der anstehende Lizenzwechsel wäre imho ein prima Zeitpunkt dafür.

Die Allermeissten von euch mit eigener DB haben das Problem eh nicht, da sie die lokale Kopie alle paar Tage/Wochen neu aufbauen und keine Diffs verarbeiten.

Gruss
Walter