Soweit ich das sehe, setzt gpsbabel einfach alle Knoten in Waypoints und alle Ways in Routen (oder tracks?) um. Die Auflistung der Relationselemente schaut es sich wohl nicht an. Ist halt nur ein simples Umsetzungsprogramm.
Es würde reichen, nur die Punkte in Waypoints umzusetzten, die nicht Teile der Ways sind.
Wenn du also nur ways in der Relation hast, kannst du zumindest schon mal die Waypoints mit nem Editor rauslöschen. Das Sortieren der Relationelemente geht nur über preprocessing. Vielleicht hab ich ja irgendwann mal Lust dazu 
Kreisverkehre wertet emaite nicht optimal aus; sie bilden immer eigene Segmente. Man könnte die Knoten des Kreisverkehrs mit den freien Enden der Wege abgleichen, und nur den notwendigen Teil des Kreisverkehrs ins gpx übernehmen. Das ist immer noch besser als Kreisverkehre im OSM aufzutrennen.
Und ja, Kreisverkehre gibt es auch bei Jakobswegen.
Einbahnstraßenregelungen kann emaitie natürlich nicht mehr so umsetzen, daß nur noch ein Segment für die ganze Relation herauskommt, aber das Problem hast du bei deinen Jakobswegen ja nicht.
Dafür gibt es als Flächen gemappte Fußgängerzonen, die ebenfalls als eigene Segmente verbleiben. Ich lege da immer gerne mal ein highway=pedestrian quer über den Platz, der dann in der Karte nicht sichtbar ist, weil der Platz das gleiche tag hat. Manche lokalen Mapper störts trotzdem.
Gruß,
ajoessen
