su -c 'gpsbabel -r -t -w -D4 -i gpx -f /dev/ttyUSB0 -o gpx -F daten.gpx'
#
# oder
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su -c 'gpsbabel -r -t -w -D4 -i gpx -f usb: -o gpx -F daten.gpx'

Wäre mein erster Versuch … vielleicht speichert das Teil ja intern schon im GPX-Format …

flux.